1、靠見(jiàn)效速度評(píng)價(jià)商品好壞微生物肥料效果的發(fā)揚(yáng)與微生物菌群繁衍速度、菌群數(shù)量關(guān)系緊密，菌群生長(zhǎng)存在周期，這一點(diǎn)是與化學(xué)肥料和植物調(diào)理劑的區(qū)別，這也就出現(xiàn)了微生物肥料速效性不如化學(xué)肥料與植物調(diào)理劑的現(xiàn)象。見(jiàn)效慢并不意味著微生物是無(wú)效果的，能在較長(zhǎng)工夫內(nèi)就可以看到作物長(zhǎng)勢(shì)清楚改善的品種也未必是好的林芝菌肥或菌劑，其中也不乏一些添加了植物調(diào)理劑的品種。

2、種類(lèi)混亂，分不清運(yùn)用的是菌劑還是林芝菌肥微生物肥料包括復(fù)合微生物肥料和生物無(wú)機(jī)肥：復(fù)合微生物肥料是有益微生物與營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)復(fù)合而成的活菌制品；生物無(wú)機(jī)肥是有益微生物與經(jīng)無(wú)害化處置的無(wú)機(jī)物料（畜禽糞便、農(nóng)作物秸稈等）復(fù)合而成的活菌制品。菌劑、菌肥的區(qū)別在于商品中營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)及無(wú)機(jī)物料的含量，運(yùn)用中需結(jié)合理論需求選擇對(duì)路商品。

3、以爲(wèi)一種商品中菌的種類(lèi)越多、菌種數(shù)量越大越好微生物肥料的運(yùn)用效果會(huì)遭到不同菌種生長(zhǎng)習(xí)性的影響，盲目的復(fù)合，極易構(gòu)成菌種間的拮抗，影響效果發(fā)揚(yáng)。數(shù)量不能代表全部，不但要看菌數(shù)量，還要看有效活菌的數(shù)量，運(yùn)用后起作用的只需活菌，有益活菌數(shù)量越大效果會(huì)表現(xiàn)越好。影響商品運(yùn)用效果的要素除了菌的種類(lèi)及數(shù)量外，菌的純度至關(guān)重要，當(dāng)商品中霉菌雜菌數(shù)及雜菌率超標(biāo)時(shí)也會(huì)影呼使用，市場(chǎng)上少數(shù)不合格商品中會(huì)含有致病菌，本意是用有益菌修復(fù)土壤，運(yùn)用了不合格品種，反而會(huì)惹起致病菌繁衍，招致病害發(fā)作。

4、以爲(wèi)運(yùn)用一次就可以，一次運(yùn)用作用可持續(xù)多年部分微生物施入土壤后會(huì)大批繁衍，當(dāng)數(shù)量抵達(dá)一定程度后就會(huì)成爲(wèi)優(yōu)勢(shì)菌群，但隨著外部環(huán)境的改動(dòng)，如化肥的超量運(yùn)用、殺菌劑的運(yùn)用、高溫悶棚等都會(huì)招致有益菌死亡，從而影響有益菌群在土壤微生物系統(tǒng)中的地位，要繼續(xù)堅(jiān)持有益菌群的地位，就需求在作物的生暫時(shí)多次運(yùn)用微生物肥料來(lái)補(bǔ)充有益菌。

5、不注重菌的種類(lèi)，以爲(wèi)一種菌可以處置多種成果菜農(nóng)在選購(gòu)微生物肥料時(shí)只注重是不是含菌，而不關(guān)注菌的種類(lèi)，缺乏對(duì)癥用菌的看法，運(yùn)用了不對(duì)癥的菌品種，商品效果難以發(fā)揚(yáng)，難以抵達(dá)用戶目的?，F(xiàn)階段在農(nóng)業(yè)部獲得登記的微生物品種有根瘤菌菌劑、固氮菌菌劑、解磷類(lèi)微生物菌劑、硅酸鹽微生物菌劑、光合細(xì)菌菌劑、無(wú)機(jī)物料腐熟劑、促生菌劑、菌根菌劑、生物修復(fù)菌劑。

6、微生物肥料可以替代化肥土壤肥力由生物肥力、化學(xué)肥力、物理肥力三部分組成，運(yùn)用微生物肥料后能提高土壤的生物肥力，可以間接促退步學(xué)肥力和物理肥力的提高。運(yùn)用微生物肥料不能完全替代化肥，但可以提高肥料使用率，添加部分化肥的投入。

二、微生物肥施用上的誤區(qū)：不只在對(duì)微生物肥料看法上存在誤區(qū)，在運(yùn)用進(jìn)程中也異常存在誤區(qū)，而在運(yùn)用時(shí)沒(méi)有避開(kāi)這樣的誤區(qū)就會(huì)構(gòu)成微生物肥料沒(méi)有效果。運(yùn)用中存在的誤區(qū)有以下三個(gè)方面：

1、與殺菌劑混用，降低活性微生物肥料中含有活菌成分，將微生物肥料與殺細(xì)菌藥劑混合運(yùn)用且長(zhǎng)時(shí)間放置，極易影響菌的活性降低并構(gòu)成部分菌死亡。

2、注重運(yùn)用，輕視運(yùn)用量運(yùn)用微生物肥料商品能取得好的效果，前提是要用足量。土壤中的微生物種類(lèi)單一、數(shù)量龐大，接種的外來(lái)有益菌要構(gòu)成優(yōu)勢(shì)菌群，需求閱歷來(lái)自環(huán)境的考驗(yàn)和土壤原有微生物的競(jìng)爭(zhēng)，爲(wèi)了促進(jìn)有益菌的繁衍需求人爲(wèi)創(chuàng)造有利于有益菌生長(zhǎng)的條件，如改良酸化土壤，調(diào)整土壤酸堿度；增施無(wú)機(jī)肥，提高土壤物理肥力；添加微生物菌的數(shù)量等。

3、運(yùn)用時(shí)期掌握不當(dāng)多數(shù)微生物怕紫外線、高溫，所以土壤表層撒施、高溫強(qiáng)光下噴霧運(yùn)用一定沒(méi)有效果。做底肥、溝施、穴施、灌根運(yùn)用時(shí)采取局部用肥的方法更有利于肥效的發(fā)揚(yáng)。不同類(lèi)型的微生物菌劑不要亂用。比如用于糞肥發(fā)酵的菌劑中主要含量嗜熱菌、厭氧菌等，可以順應(yīng)糞肥發(fā)酵時(shí)發(fā)作的高溫環(huán)境，而運(yùn)用普通的菌劑或菌肥不只沒(méi)有效果還會(huì)構(gòu)成資金糜費(fèi)。